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Part8—Denovo FCS Express 6 細胞周期的流式數(shù)據(jù)分析

作者:admin信息來源:達科為日期:2018年01月31日打印字體:  
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Denovo的微信推文已經(jīng)陪伴大家走過了7期的內(nèi)容,想必大家已經(jīng)被Denovo強大的流式數(shù)據(jù)分析功能徹底圈粉了吧!前面7期的內(nèi)容主要介紹了Denovo軟件的安裝,流式數(shù)據(jù)分析的入門篇,流式數(shù)據(jù)的批量處理,多色分析及流式凋亡數(shù)據(jù)分析。那么本期內(nèi)容更厲害了呢!在本期內(nèi)容中小達君將給大家奉上細胞周期的流式數(shù)據(jù)分析的相關(guān)內(nèi)容。趕快打開電腦,搬好小板凳,和小達君一起開始實戰(zhàn)演習(xí)吧~

演示工具:裝有Denovo FCS Express 6的電腦一臺(參考入門篇的試用裝版本安裝~)

演示數(shù)據(jù):細胞周期的流式數(shù)據(jù)分析

演示內(nèi)容:細胞周期數(shù)據(jù)的分析,關(guān)于細胞周期各個參數(shù)的調(diào)用,統(tǒng)計學(xué)圖表的建立

1.添加實驗數(shù)據(jù)


參考前面推文可知,在Denovo軟件中添加數(shù)據(jù)的方式有多種,以下通過Data list命令按鈕直接添加,具體操作如下: 



2.數(shù)據(jù)分析


將數(shù)據(jù)添加進來之后,圈門,把目的細胞拖拽出來,單獨分析,首先需要去除粘連細胞,不同的流式細胞儀排除粘連細胞時,用到的參數(shù)有時候不一樣,此處,通過改變PI通道的參數(shù)(分別改成FL2-A及FL2-W)來去除粘連細胞,具體操作如下圖:



3.細胞周期的流式數(shù)據(jù)分析模板建立


a.粘連細胞去除之后,可直接調(diào)用Denovo自帶的細胞周期分析模板,完成數(shù)據(jù)分析,具體操作如下:



b.將細胞周期分析的模板調(diào)出來之后,點擊OK,會彈出如下圖所示的界面,然后可以利用insert按鈕,插入文本框,從而可實現(xiàn)圖注的編輯,如下圖所示(我們可以對圖中的每個峰進行命名,從而可以對細胞周期中的各個時期進行命名和解釋):



4.細胞周期的流式數(shù)據(jù)分析中相關(guān)參數(shù)的調(diào)用


a.在細胞周期分析的模板中,有不同的模板可以調(diào)用,用戶可以根據(jù)自己的需要,選擇相應(yīng)的細胞周期數(shù)據(jù)分析模型,具體操作如下圖所示:



b.不同的細胞周期數(shù)據(jù)分析模型,其分析標(biāo)準(zhǔn)不一樣,Denovo對不同的模型均作了相關(guān)的定義,用戶可以直接查看,具體操作如下:



c.當(dāng)完成細胞周期數(shù)據(jù)分析后,接上面一步,可以通過Statistics按鈕,將相關(guān)的參數(shù)調(diào)出來,具體展示如下:



5.利用Spreadsheets插入圖表


(參考Part7的微信推文,里面有詳細的關(guān)于Spreadsheets的使用)

a.舉例,對細胞周期中G1期,S期及G2期各細胞比列的情況分析并做成柱形圖及餅狀圖,直接插入Spreadsheets,然后將相應(yīng)的數(shù)據(jù)拖拽入表格中,點擊insert命令按鈕,插入相應(yīng)的柱形圖和餅狀圖,操作如下:



b.同時通過Format按鈕可以更改圖形的相關(guān)參數(shù),可以使圖表的排版及色彩布置達到令用戶滿意的效果,如下圖所示:(具體操作可參見part7-凋亡數(shù)據(jù)分析的中關(guān)于插入圖表的介紹)



由于微信的演示空間有限,本期的內(nèi)容介紹就到此結(jié)束,Denovo FCS Express 6還有更多,更好,更強的流式數(shù)據(jù)分析功能,我們期待和您共同探討,感興趣的可以在下方留言并留下您的聯(lián)系方式,我們技術(shù)部的同事會和您聯(lián)系~


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